1、人力资源和社会保障部(简称人社部):人社部是负责全国职业资格证书制度的主管部门，负责对心理咨询师证书的发放进行审批，人社部下设职业技能鉴定中心，负责职业技能鉴定工作的组织和实施，在人社部的指导下，各地人力资源社会保障局负责对本地区的心理咨询师证书申请进行初审和复审。

2、国家卫生健康委员会(简称卫健委):卫健委是负责全国卫生健康工作的主管部门，负责对心理咨询师的专业能力进行评估，卫健委下设心理健康司，负责心理健康工作的组织和实施，在卫健委的指导下，各地卫生健康委员会负责对本地区的心理咨询师申请进行专业能力评估。

3、教育部：教育部是负责全国教育工作的主管部门，负责对心理咨询师的教育背景和学历进行审核，教育部下设教育考试院，负责全国各类考试的组织和实施，在教育部的指导下，各地教育考试院负责对本地区的心理咨询师申请进行学历审核。

4、国家市场监督管理总局(简称市场监管总局):市场监管总局是负责全国市场监管工作的主管部门，负责对心理咨询师的职业道德进行审查，市场监管总局下设反垄断与反不正当竞争执法局，负责反垄断和反不正当竞争工作的组织和实施，在市场监管总局的指导下，各地市场监管局负责对本地区的心理咨询师申请进行职业道德审查。

5、国家中医药管理局(简称中医药局):中医药局是负责全国中医药工作的主管部门，负责对心理咨询师的中医药相关背景进行审核，中医药局下设中医药发展局，负责中医药工作的组织和实施，在中医药局的指导下，各地中医药局负责对本地区的心理咨询师申请进行中医药相关背景审核。

6、各省、自治区、直辖市人力资源和社会保障厅(局)、卫生健康委员会、教育考试院、市场监管局、中医药局：这些部门在上述部门的指导下，分别负责本地区的心理咨询师证书申请的初审、复审、专业能力评估、学历审核、职业道德审查和中医药相关背景审核等工作。

国家心理咨询师证发放单位的审批部门主要包括人力资源和社会保障部、国家卫生健康委员会、教育部、国家市场监督管理总局和国家中医药管理局等相关部门，这些部门共同负责对心理咨询师证书的发放进行审批，确保心理咨询师的专业素质和职业道德得到保障。